Паводковой комиссией проведено обследование берегозащитных сооружений, организован ежесуточный контроль изменения гидрометеорологической обстановки, а также круглосуточное дежурство ответственных лиц из числа инженерно-технических работников. На ГЭС укомплектованы дежурные бригады для аварийно-восстановительных и спасательных работ. После завершения паводка 2010 года, будет проведено комиссионное обследование гидротехнических сооружений гидроузел на реках Большой Зеленчук, Маруха и Аксаут, нижнего бьефа здания ГЭС. В результате проверки комиссия пришла к выводу, что сооружения Зеленчукской ГЭС подготовлены к пропуску половодья 2010. Персонал и службы эксплуатации готовы к работе в условиях прохождении весеннего паводка.
Филиал ОАО «РусГидро» — «Карачаево-Черкесский филиал» и Администрация муниципального Зеленчукского района заключили соглашение о порядке взаимодействия по вопросам оперативного представления информации и оперативного реагирования сторон на нештатные ситуации в период пропуска половодья через гидросооружения Зеленчукской ГЭС.
Соглашение действует в паводковый период, который обычно начинается в апреле и продолжается до сентября включительно.
Соглашение о взаимодействии имеет большое значение не только для Зеленчукского района и филиала ОАО «РусГидро» — «Карачаево-Черкесский Филиал», но и для Карачаевского и Усть-Джегутинского районов. Обмен оперативной информацией позволит оптимизировать совместную работу во время паводка на реке Кубань.
Пропускная способность гидротехнического сооружения при максимальном паводке при всех открытых затворах: гидроузел на р. Большой Зеленчук — 478 м3/с; гидроузел на р. Маруха — 610 м3/с; гидроузел на р. Аксаут ?633м3/с; На сегодняшний день отметка нормального подпорного уровня (НПУ) на р. Большой Зеленчук 1012,0 м., на р. Маруха 1000,45 м, на р. Аксаут 996,55 м. Средние расходы воды по рекам: Большой Зеленчук 35м3/с, Аксаут 11, 5 м3/с, Маруха 11,8 м3/с.